More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0503 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  62.95 
 
 		 224 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  61.16 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  55.31 
 
 		 226 aa  244  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  48.2 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  46.58 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  48.18 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.55 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  45.25 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  44.04 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  49.02 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  43.58 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  43.58 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  44.24 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.78 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  44.5 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  44.5 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  44.04 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.25 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  46.61 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  45.15 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  38.84 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  37.91 
 
 		 269 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  39.73 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  41.36 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  39.91 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  43.06 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.84 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  38.97 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.71 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  41.12 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  38.65 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  38.65 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  42.66 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.2 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  39.32 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.62 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  36.67 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  36.04 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.01 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  36.79 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.56 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  35.27 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  41.62 
 
 		 271 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  45.51 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 		 281 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 266 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.65 
 
 		 278 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  36.24 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  34.58 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.19 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  36.24 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.95 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  39.38 
 
 		 593 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  36.6 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  39.58 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 518 aa  135  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  38.57 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  37.88 
 
 		 628 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 568 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  33.62 
 
 		 290 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  39.81 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  39.27 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.74 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.35 
 
 		 274 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>