More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2126 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  48.18 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  48.18 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.49 
 
 
277 aa  216  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.67 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  45.22 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  45.87 
 
 
272 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
279 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.47 
 
 
280 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
300 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
300 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.82 
 
 
280 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
280 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
280 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
280 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
280 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 
280 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
300 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.47 
 
 
280 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  44.8 
 
 
281 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.47 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  47.96 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.7 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  50.42 
 
 
276 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  47.08 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  53.77 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 
277 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
276 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  47.19 
 
 
277 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 
285 aa  192  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.68 
 
 
272 aa  191  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  45.68 
 
 
273 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 
279 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.14 
 
 
398 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.49 
 
 
278 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 
277 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 
402 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  50.86 
 
 
277 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.17 
 
 
283 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.57 
 
 
267 aa  186  3e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
395 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.53 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  40.87 
 
 
250 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.25 
 
 
276 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  40.27 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
406 aa  178  5.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  50.53 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
281 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.25 
 
 
278 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  52.13 
 
 
243 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 
281 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
403 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 
284 aa  175  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.34 
 
 
280 aa  175  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  43.56 
 
 
275 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
269 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
403 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0668  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 
408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  50.64 
 
 
284 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 
277 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  43.15 
 
 
380 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  44.92 
 
 
226 aa  171  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  39.84 
 
 
283 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  39.84 
 
 
283 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
453 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  52.13 
 
 
233 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 
277 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  46.19 
 
 
272 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  51.27 
 
 
271 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
285 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 
541 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
269 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
243 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
269 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 
259 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
310 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
411 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
277 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  46.84 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  45.1 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 
440 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  39.09 
 
 
593 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  40.34 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  40.45 
 
 
282 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  39.17 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.56 
 
 
344 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  40.23 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  41.2 
 
 
568 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  46.28 
 
 
226 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 
267 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.78 
 
 
281 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
630 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  47.15 
 
 
222 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>