More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3661 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  61.43 
 
 		 226 aa  274  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  55.16 
 
 		 226 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  60.27 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  53.18 
 
 		 221 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  55.5 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  56.81 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  49.33 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  51.57 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  53.14 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  56.34 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  56.34 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  56.34 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  44.55 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  47.27 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  47.73 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  49.04 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  48.34 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.55 
 
 		 246 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  46.79 
 
 		 256 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  44.09 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  45.87 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  51.47 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  44.55 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  46.48 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  49.33 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  43.64 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  48.57 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  43.96 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  43.96 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.32 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  45.98 
 
 		 282 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 		 246 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  44.17 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  42.99 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  41.96 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  43.66 
 
 		 277 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  45.06 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  44.39 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  41.59 
 
 		 281 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  51.14 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  42.6 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.11 
 
 		 283 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  43.16 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  44.55 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.86 
 
 		 280 aa  158  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 398 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  40.93 
 
 		 497 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 402 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  44.34 
 
 		 273 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 395 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.28 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.74 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  41.59 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  41.75 
 
 		 269 aa  151  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.74 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  37.68 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  41.67 
 
 		 568 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  36.24 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  41.43 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  31.84 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  43.69 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 280 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  37.56 
 
 		 605 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 280 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.42 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  39 
 
 		 282 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 280 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 453 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>