More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4655 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  100 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  63.06 
 
 
224 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  60.99 
 
 
227 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 
231 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  66.22 
 
 
232 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  65.77 
 
 
232 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  65.77 
 
 
232 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  63.3 
 
 
231 aa  264  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  60.55 
 
 
243 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  59.91 
 
 
224 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  54.87 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  49.77 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  55.41 
 
 
233 aa  235  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  61.26 
 
 
230 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  53.14 
 
 
226 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  60.29 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  55.29 
 
 
246 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  46.58 
 
 
226 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  53.36 
 
 
233 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
245 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  52.07 
 
 
256 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  52.29 
 
 
248 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  45.87 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  52 
 
 
228 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  46.64 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  43.84 
 
 
224 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  48.57 
 
 
222 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  45.15 
 
 
224 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  47.14 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  42.18 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  49.53 
 
 
221 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  42.01 
 
 
226 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  46.15 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  40.85 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  40.43 
 
 
273 aa  161  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  40.43 
 
 
273 aa  161  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 
284 aa  161  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.96 
 
 
276 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
258 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
264 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  42.79 
 
 
246 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 
281 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
246 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  43.69 
 
 
276 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  43.37 
 
 
277 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  38.03 
 
 
275 aa  151  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.38 
 
 
279 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  40.38 
 
 
247 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  39.42 
 
 
278 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
242 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.56 
 
 
398 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  45.36 
 
 
232 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
254 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.18 
 
 
278 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.78 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  38.14 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 
270 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
277 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
299 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  37.72 
 
 
283 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  37.72 
 
 
283 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 
280 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  36.74 
 
 
593 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
252 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
270 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  42.47 
 
 
246 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
271 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  43.4 
 
 
251 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  43.4 
 
 
247 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
256 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  43.4 
 
 
247 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  40.1 
 
 
282 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  40.87 
 
 
273 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.74 
 
 
252 aa  141  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
243 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  38.39 
 
 
282 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 
248 aa  141  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  42.48 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  36.24 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  45.51 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  35.94 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  39.69 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.7 
 
 
282 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.24 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.89 
 
 
568 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  38.57 
 
 
269 aa  139  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.89 
 
 
380 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.14 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  38.84 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.14 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.54 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>