More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3686 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  53.18 
 
 
226 aa  244  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  49.55 
 
 
226 aa  235  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
243 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  52.2 
 
 
226 aa  215  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  51.43 
 
 
233 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  47.71 
 
 
254 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  48.61 
 
 
222 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  45.87 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  46.12 
 
 
224 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  43.58 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
224 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  43.89 
 
 
227 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
231 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  45.67 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  45.59 
 
 
224 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  42.86 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  42.6 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  44.5 
 
 
226 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  41.9 
 
 
230 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  42.59 
 
 
232 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  42.59 
 
 
232 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  42.59 
 
 
232 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  38.21 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.26 
 
 
246 aa  161  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  39.81 
 
 
278 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
299 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  40.85 
 
 
272 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
233 aa  158  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  38.7 
 
 
248 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
228 aa  157  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.4 
 
 
274 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
277 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 
310 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
277 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.64 
 
 
274 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
280 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  39.81 
 
 
272 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  39.81 
 
 
247 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
402 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.5 
 
 
276 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  40.27 
 
 
221 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  36.89 
 
 
303 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  39.51 
 
 
276 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  35.27 
 
 
238 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 
280 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.64 
 
 
230 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
280 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  39.34 
 
 
254 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  41 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.32 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  38.74 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  41.15 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 
300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 
277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  38.79 
 
 
266 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 
300 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
280 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
246 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
280 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 
285 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  40.72 
 
 
281 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.42 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
243 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 
300 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
271 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  37.27 
 
 
246 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 
279 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.43 
 
 
398 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
285 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  35.24 
 
 
282 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 
294 aa  144  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  39 
 
 
251 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.92 
 
 
278 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
395 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
257 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  35.71 
 
 
275 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 
277 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  38.21 
 
 
273 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  38.46 
 
 
240 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  38.21 
 
 
273 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  38.97 
 
 
273 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 
281 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 
283 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 
250 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  35.47 
 
 
628 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 
281 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 
279 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
453 aa  141  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  34.6 
 
 
250 aa  141  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  35.07 
 
 
284 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.97 
 
 
254 aa  141  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>