More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3350 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  60.19 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  60.68 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  60.29 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  55.79 
 
 		 246 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  54.71 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  53.81 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  57.69 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  56.19 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  56.73 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  48.34 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  55.77 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  55.77 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  50 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  55.29 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  42.25 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  50.25 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  47.2 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  41.9 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  53.6 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  39.73 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  53.73 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  39.73 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  41.52 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  44.55 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  40.98 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  39.62 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  38.5 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.58 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  37.69 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  37.69 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.97 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  37.74 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  45.51 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  42.93 
 
 		 276 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.26 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 		 270 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  39.27 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.19 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  42.13 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 402 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  37.82 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  37.82 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  38.43 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  34.1 
 
 		 288 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  37.85 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  34.13 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  36.14 
 
 		 286 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  33.63 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  36.32 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.91 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  32.84 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  33.48 
 
 		 278 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.31 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  27.8 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.5 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  37.56 
 
 		 337 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  37.17 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  37.77 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.01 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.88 
 
 		 280 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  46.11 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 453 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  38.78 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.11 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  34.21 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  39.69 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  38.1 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1753  ABC transporter-like  39.78 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0198415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>