More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1731 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  72.2 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  72.2 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  71.75 
 
 		 232 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  67.12 
 
 		 231 aa  294  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  66.21 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  63.06 
 
 		 226 aa  279  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  58.48 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  55.16 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  55.51 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  49.78 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  52.29 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  52.97 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  51.16 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  54.46 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  46.58 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  55.36 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  45.7 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  47.73 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  45.7 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  44.29 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  45.95 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  44.39 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  45.54 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  50.51 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  41.52 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  46.12 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  43.98 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  41.4 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 264 aa  148  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.58 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  38.6 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  36.24 
 
 		 269 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  36.61 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  40.83 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40.1 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.53 
 
 		 280 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 		 253 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  37.44 
 
 		 303 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.19 
 
 		 398 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  34.48 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  38.46 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.13 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  38.81 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.46 
 
 		 284 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 		 280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  36.28 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  34.78 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  38.01 
 
 		 276 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.48 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  36.12 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  35.24 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.26 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.86 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  32.91 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.48 
 
 		 593 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  35.16 
 
 		 497 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  36.89 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 		 300 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  38.54 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  38.54 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  38.54 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.46 
 
 		 271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.72 
 
 		 281 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 		 283 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  34.74 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  34.91 
 
 		 380 aa  125  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>