More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2175 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  97.15 
 
 		 246 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  81.48 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  49.38 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  47.81 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  48.86 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.17 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  40.37 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  44.23 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  35.59 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1538  ABC transporter related  48.54 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2321  ABC transporter related  48.06 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  41.83 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  37.05 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  40 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  41.33 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  42.03 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  42.21 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  37.9 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  38.1 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  38.84 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  38.84 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  39.44 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  38.39 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  35.05 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  37.56 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.37 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  37.98 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.87 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  39.37 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  34.68 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  36.62 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  42.78 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.55 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  38.39 
 
 		 541 aa  125  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  39.9 
 
 		 458 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.2 
 
 		 550 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  40.43 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.54 
 
 		 568 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  36.7 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  33.76 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  37.21 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  35.65 
 
 		 282 aa  118  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  38.92 
 
 		 509 aa  118  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  40.7 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.68 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 568 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.63 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  36.02 
 
 		 497 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.38 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  37.17 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.61 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.45 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  37.23 
 
 		 593 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  35.41 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  35.21 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 627 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.26 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.55 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.65 
 
 		 278 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  35.41 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2035  ABC transporter related  39.71 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.65 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.48 
 
 		 574 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.12 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  35.07 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.84 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.12 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  37.07 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.1 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  33.98 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1255  ABC transporter related  32.86 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.65 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  33.49 
 
 		 287 aa  111  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  33.33 
 
 		 477 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 		 285 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.67 
 
 		 605 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>