More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4263 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  78.57 
 
 		 252 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  57.26 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.49 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.12 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  57.76 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.66 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  55.56 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  57.63 
 
 		 271 aa  252  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 		 270 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  51.46 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  51.05 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 266 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.36 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.08 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  53.59 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  55.08 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  55.08 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  55.08 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.88 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 284 aa  218  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.81 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  46.25 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.57 
 
 		 276 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 		 411 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 		 402 aa  210  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.58 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 273 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 		 541 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.3 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 		 395 aa  205  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  43.16 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  42.31 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  43.22 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 453 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  41.88 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 456 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  41 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  39.66 
 
 		 282 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  43.51 
 
 		 380 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  38.24 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 		 276 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 		 403 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  43.28 
 
 		 571 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 630 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  40.83 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  39.75 
 
 		 593 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.78 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 274 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.62 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  38.62 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  42.86 
 
 		 582 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  39.74 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  39.32 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.24 
 
 		 568 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>