More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3433 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  69.01 
 
 
218 aa  297  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  66.35 
 
 
232 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  57.89 
 
 
221 aa  240  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  62.56 
 
 
254 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 
242 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  62.63 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  51.43 
 
 
273 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  53.77 
 
 
277 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
239 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
239 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  45.54 
 
 
221 aa  201  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  47.14 
 
 
242 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  48.83 
 
 
243 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.83 
 
 
257 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  47.66 
 
 
250 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
253 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  47.64 
 
 
251 aa  188  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  48.33 
 
 
252 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  43.66 
 
 
217 aa  184  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
249 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 
277 aa  177  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
271 aa  177  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
259 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.55 
 
 
398 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  42.25 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 
243 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.44 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
395 aa  170  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  44.71 
 
 
269 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.79 
 
 
278 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 
541 aa  168  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
246 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 
277 aa  168  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
281 aa  167  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 
403 aa  167  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
440 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
250 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
243 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 
254 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
266 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
254 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
403 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.13 
 
 
310 aa  166  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  40.2 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
251 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  43.16 
 
 
217 aa  165  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.67 
 
 
259 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
278 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 
456 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  42.45 
 
 
246 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  41.23 
 
 
239 aa  164  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 
277 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
453 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 
411 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
247 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1753  ABC transporter-like  45.59 
 
 
230 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0198415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
256 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
284 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
243 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  45.05 
 
 
265 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 
270 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
244 aa  158  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  39.01 
 
 
278 aa  158  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.91 
 
 
276 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 
255 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  42.5 
 
 
221 aa  157  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.41 
 
 
261 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  41.51 
 
 
258 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
271 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 
270 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 
272 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
276 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  41.04 
 
 
254 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  40.09 
 
 
282 aa  154  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  43.48 
 
 
247 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  43.48 
 
 
247 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  43.48 
 
 
251 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 
281 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  38.89 
 
 
380 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0554  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  38.61 
 
 
216 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  38.86 
 
 
239 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  39.34 
 
 
244 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 
286 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 
305 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.79 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  35.68 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 
285 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  36.11 
 
 
283 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
276 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>