More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  44.14 
 
 
282 aa  195  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
276 aa  194  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  48.34 
 
 
265 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
274 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
251 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  43.6 
 
 
242 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  43.43 
 
 
278 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
402 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
284 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 
281 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.75 
 
 
278 aa  174  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  42.79 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  39.13 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.12 
 
 
398 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.2 
 
 
281 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0493  ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 
262 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
254 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
255 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.31 
 
 
380 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0521  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 
249 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 
254 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0332  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.92 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.105334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
273 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
403 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
395 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 
310 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
249 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
249 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
770 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
305 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.38 
 
 
284 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
264 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
283 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
411 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
277 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
403 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  40.58 
 
 
278 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 
252 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.4 
 
 
252 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 
259 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  36.24 
 
 
288 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
276 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 
243 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  37.79 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  38.31 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
277 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2303  ABC transporter related  39.71 
 
 
259 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  39.17 
 
 
232 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  37.05 
 
 
810 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0526  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
253 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0304047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
568 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
241 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
270 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1951  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.21 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
286 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.6 
 
 
571 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.26 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  40 
 
 
548 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.43 
 
 
282 aa  151  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 
277 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 
285 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 
259 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  38.43 
 
 
218 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  40.55 
 
 
557 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 
283 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  38.64 
 
 
221 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
234 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.5 
 
 
280 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  35.85 
 
 
283 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
456 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  38.42 
 
 
226 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  39.7 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
453 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  41.71 
 
 
541 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.75 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  35.51 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  39.81 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  38.39 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  37.5 
 
 
290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
281 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 
244 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.79 
 
 
280 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.67 
 
 
568 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  37.5 
 
 
574 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  37.2 
 
 
237 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
270 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.05 
 
 
277 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40 
 
 
291 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3474  ABC transporter related  38.32 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
256 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>