More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0715 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
276 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.35 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40 
 
 
274 aa  208  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 
278 aa  195  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 
453 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
403 aa  194  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.43 
 
 
398 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 
267 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  37.24 
 
 
280 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
395 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 
285 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 
278 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
281 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  37.66 
 
 
284 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 
281 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
456 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.92 
 
 
288 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
440 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.75 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  39.24 
 
 
283 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.73 
 
 
541 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.25 
 
 
411 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 
272 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 
285 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 
276 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
402 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
285 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 
273 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.74 
 
 
261 aa  174  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.56 
 
 
291 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
284 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 
281 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.03 
 
 
247 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.89 
 
 
271 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
283 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
277 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  34.31 
 
 
380 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 
277 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.87 
 
 
277 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  37.13 
 
 
282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.98 
 
 
310 aa  164  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  39.5 
 
 
263 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.22 
 
 
403 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2189  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.03 
 
 
271 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.9 
 
 
274 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2617  ABC transporter related protein  31.8 
 
 
262 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2355  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.61 
 
 
271 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2196  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.61 
 
 
271 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2142  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.61 
 
 
271 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2242  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.61 
 
 
271 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  normal  0.066673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
279 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
282 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.35 
 
 
259 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.67 
 
 
257 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.73 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  33.76 
 
 
240 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.8 
 
 
280 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.03 
 
 
254 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.19 
 
 
568 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  36.67 
 
 
277 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
244 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
278 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.51 
 
 
256 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  37.39 
 
 
242 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  38.93 
 
 
288 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  32.22 
 
 
242 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  31.84 
 
 
226 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  36.21 
 
 
282 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
279 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 
278 aa  148  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
276 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.04 
 
 
277 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  35.8 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.89 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.08 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  31.97 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.2 
 
 
238 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.8 
 
 
264 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 
280 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
255 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  30.41 
 
 
243 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.93 
 
 
243 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  35.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
568 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
270 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.91 
 
 
548 aa  145  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.22 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  33.76 
 
 
239 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  36.69 
 
 
303 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
566 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.71 
 
 
252 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>