More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3592 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
271 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.29 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  58.16 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.34 
 
 
279 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 
541 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
283 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  46.47 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
440 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  45.16 
 
 
380 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
276 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
276 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
278 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
285 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.13 
 
 
281 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
281 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
395 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 
411 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.58 
 
 
285 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.52 
 
 
278 aa  204  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
456 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
402 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 
284 aa  201  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
285 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.7 
 
 
398 aa  195  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45.12 
 
 
291 aa  194  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 
310 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 
284 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
281 aa  191  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 
288 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
403 aa  191  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
281 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  42.08 
 
 
242 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
267 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.57 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  43.86 
 
 
284 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
403 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  36.59 
 
 
263 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.71 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2242  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  normal  0.066673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2196  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2142  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2355  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2189  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
271 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.65 
 
 
274 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.71 
 
 
277 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.08 
 
 
244 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
273 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
256 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  36.93 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
243 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
243 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
253 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.73 
 
 
252 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
254 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
249 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  33.89 
 
 
237 aa  168  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
252 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
264 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 
272 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
259 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
258 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 
250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
274 aa  165  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.73 
 
 
280 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
279 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 
246 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
276 aa  162  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 
255 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.78 
 
 
286 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  38.82 
 
 
239 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
249 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
255 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.15 
 
 
278 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
250 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
242 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.46 
 
 
266 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
282 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  38.35 
 
 
269 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  37.96 
 
 
278 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
271 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.41 
 
 
261 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
251 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.42 
 
 
248 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  36.73 
 
 
280 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  41.84 
 
 
246 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  36.29 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  47 
 
 
247 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  47 
 
 
247 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  47 
 
 
251 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>