More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1951 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1951  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3474  ABC transporter related  68.16 
 
 		 230 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  45.29 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.46 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  38.77 
 
 		 497 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  41.71 
 
 		 605 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.84 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  41.35 
 
 		 557 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  36.57 
 
 		 574 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  37.56 
 
 		 568 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  40.8 
 
 		 593 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  39.07 
 
 		 501 aa  158  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 568 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  37.22 
 
 		 481 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.25 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 		 402 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 310 aa  156  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 		 271 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.64 
 
 		 277 aa  154  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  36.92 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.03 
 
 		 571 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.21 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 		 509 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  37.44 
 
 		 541 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.27 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  38.77 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  36.11 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 251 aa  147  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  36.77 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.77 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  36.11 
 
 		 553 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  40.18 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  38.53 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  37 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 403 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  37 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  40.53 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  37 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  37.44 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.94 
 
 		 548 aa  143  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.19 
 
 		 398 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 		 395 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  34.69 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  40.83 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  36.24 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  37.44 
 
 		 501 aa  141  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  34.8 
 
 		 576 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  39.81 
 
 		 380 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 291 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  37.66 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.21 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 		 403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  38.25 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.85 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  37.56 
 
 		 531 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3070  ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.11 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  36.92 
 
 		 581 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  38.25 
 
 		 647 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0584  membrane associated ATPase  39.91 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 579 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  37.9 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  36.32 
 
 		 287 aa  138  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 569 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  35.45 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 568 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  37.74 
 
 		 534 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 456 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>