More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2019 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  52.54 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  51.03 
 
 
243 aa  223  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  46.91 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  48.12 
 
 
250 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  52.45 
 
 
221 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  46.84 
 
 
273 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  50.94 
 
 
232 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  52.36 
 
 
214 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  49.53 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  48.85 
 
 
277 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  45.21 
 
 
221 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 
239 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
253 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  47.66 
 
 
254 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  46.73 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
254 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.91 
 
 
398 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 
278 aa  168  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  42.86 
 
 
254 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
264 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.61 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
403 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.87 
 
 
281 aa  161  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 
310 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
243 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.94 
 
 
284 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
541 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
270 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 
440 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
266 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.62 
 
 
395 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 
270 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  40.47 
 
 
251 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
244 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
277 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  40.47 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  40.47 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  36.45 
 
 
239 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1753  ABC transporter-like  43.19 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0198415  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 
249 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 
402 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  40.1 
 
 
215 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
305 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  40.38 
 
 
246 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  37.71 
 
 
255 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 
276 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
254 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
252 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  37.71 
 
 
255 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
411 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  41.38 
 
 
217 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
285 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
256 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  40.5 
 
 
242 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.81 
 
 
277 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 
242 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 
256 aa  149  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
255 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 
250 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
272 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  40.85 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.74 
 
 
291 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.43 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
456 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
258 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 
246 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 
255 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  40.76 
 
 
217 aa  145  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0554  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  35.85 
 
 
216 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.73 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.64 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.79 
 
 
252 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 
283 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
243 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  38.38 
 
 
251 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  34.89 
 
 
380 aa  142  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 
403 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  36.29 
 
 
269 aa  142  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  44.75 
 
 
271 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  41.29 
 
 
265 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  35.38 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  38.57 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.19 
 
 
284 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 
244 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.87 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  33.64 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
243 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
249 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>