More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1474 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  58.75 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  52.02 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  50.21 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  53.81 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  52.8 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  47.25 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  47.95 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  48.34 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  46.43 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  47.2 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  41.67 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 440 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  37.73 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.22 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  42.08 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 		 541 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  37.56 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 299 aa  151  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.73 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.81 
 
 		 395 aa  151  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.03 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 456 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 411 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.74 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.09 
 
 		 398 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.71 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 		 403 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  35.55 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  35.55 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.56 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  35.62 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  34.08 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.68 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  37.28 
 
 		 254 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.36 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  32.71 
 
 		 278 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 		 286 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  37.62 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  37.62 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  35.86 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  36.61 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  35.86 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  37.62 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  33.94 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  36.41 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.61 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  36.41 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  34.72 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  35.29 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  36 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.79 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  40 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.16 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.15 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.45 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 		 310 aa  138  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  36.24 
 
 		 380 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>