More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3135 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  60.08 
 
 		 250 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  60.42 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  55.04 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  52.54 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  48.75 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  54.5 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  47.64 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  47.89 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  41.2 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  45.79 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  47.14 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  44.34 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 		 403 aa  175  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 		 395 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 453 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  43.93 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.07 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 278 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.36 
 
 		 403 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.07 
 
 		 398 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 266 aa  164  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  36.45 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 541 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.36 
 
 		 270 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 271 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  37.3 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 		 402 aa  161  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  37.16 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  38.5 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  39.07 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 456 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.04 
 
 		 380 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  36.98 
 
 		 282 aa  158  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  36.11 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.61 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 440 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.48 
 
 		 291 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  38.6 
 
 		 254 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  41.04 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  35.65 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  38.01 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  35.21 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  38.01 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  38.97 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.77 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.17 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0493  ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 		 262 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  36.94 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  36.94 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1753  ABC transporter-like  38.1 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0198415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  36.49 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.32 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.23 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  39.22 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>