More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0540 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0554  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  60.56 
 
 
216 aa  262  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  60.09 
 
 
217 aa  261  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  42.63 
 
 
251 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  38.68 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  39.71 
 
 
218 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  40.2 
 
 
214 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  38.97 
 
 
232 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  41.04 
 
 
242 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
239 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  41.63 
 
 
254 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 
242 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  40.38 
 
 
254 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
239 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  37.32 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  36.5 
 
 
243 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
276 aa  141  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  39.67 
 
 
221 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.43 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  40.31 
 
 
269 aa  138  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  36.27 
 
 
250 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  40 
 
 
221 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  39.77 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  38.07 
 
 
255 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.14 
 
 
255 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 
266 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  38.07 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  39 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
243 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.43 
 
 
252 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  39.29 
 
 
278 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  40.5 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  38.29 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.63 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 
267 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 
284 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
403 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  34.87 
 
 
226 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 
541 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.82 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.5 
 
 
272 aa  128  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1130  ABC transporter-related protein  41.23 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  35.26 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  39.32 
 
 
282 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  34.87 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
274 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  39.7 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3474  ABC transporter related  37.5 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.17 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.87 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  37.7 
 
 
254 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
278 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0521  ABC transporter related  34.83 
 
 
258 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38 
 
 
330 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
249 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
249 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  35.71 
 
 
226 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 
285 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  37.23 
 
 
277 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.84 
 
 
286 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
256 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2303  ABC transporter related  35.35 
 
 
259 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38 
 
 
329 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.83 
 
 
810 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  36.5 
 
 
348 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 
277 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 
337 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.29 
 
 
280 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  38.78 
 
 
237 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 
278 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.29 
 
 
209 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.8 
 
 
411 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.87 
 
 
398 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
395 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
279 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.14 
 
 
252 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.22 
 
 
285 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  38.86 
 
 
263 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  39.88 
 
 
222 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
277 aa  121  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37 
 
 
330 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.5 
 
 
369 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
282 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
376 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
330 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
329 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
376 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.52 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0493  ABC transporter, ATPase subunit  33.83 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.85 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  34.18 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>