More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1158 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  52.31 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  47.2 
 
 		 256 aa  188  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  47.14 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  46.78 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  47.2 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  43.58 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  49.08 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  44.98 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  48.23 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  38.84 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  39.65 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  41.96 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  46.29 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  46.29 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  45.85 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  41.56 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  45.1 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  38.39 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  41.89 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  41.07 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.3 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  35.27 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  50 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  37.91 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.33 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  38.84 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  38.46 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  36.68 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  39.55 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  36.74 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.07 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.89 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  31.73 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  32.27 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 284 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  32.39 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  33.33 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.18 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.19 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.57 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.41 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 335 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 335 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.73 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 335 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 		 335 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.48 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.87 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.11 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.87 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.87 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0062  cobalt ABC transporter ATPase  31.3 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  30.8 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  38.42 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.87 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.11 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  31.73 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  31 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.81 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 359 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.11 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.81 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  32.59 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  35.92 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 627 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 509 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  34.78 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.78 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  27.69 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.39 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.07 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1538  ABC transporter related  35.27 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.13 
 
 		 641 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  34.85 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.56 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  34.85 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  33.64 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.84 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>