More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3289 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  77.38 
 
 		 254 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  48.18 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  49.02 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  50.48 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  47.27 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  48.61 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  47.73 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  48.2 
 
 		 256 aa  191  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  49.09 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  48.2 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  48.57 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  47.49 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  47.27 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  48.79 
 
 		 248 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  47.96 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  47.96 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  47.96 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  44.76 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  45.02 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  44.66 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  44.71 
 
 		 246 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.66 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  40.38 
 
 		 282 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  41.89 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  44.55 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  38.32 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  45.54 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  42.44 
 
 		 276 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  41.78 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1538  ABC transporter related  41.01 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 398 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2321  ABC transporter related  40.55 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  45.86 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  36.09 
 
 		 380 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.86 
 
 		 280 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  34.98 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  35.78 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  45.4 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  36.41 
 
 		 282 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  35.78 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.15 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.8 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  34.27 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  33.8 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.51 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.32 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  33.17 
 
 		 303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  38.46 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.43 
 
 		 440 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.78 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  43.15 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.71 
 
 		 281 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.31 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 		 395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  34.56 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  34.56 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  34.83 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.06 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  41.44 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.73 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 285 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  41.67 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 259 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.78 
 
 		 278 aa  128  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 285 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  35.05 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  38.43 
 
 		 325 aa  128  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 280 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  43.9 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>