More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0805 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0805  ABC transporter related  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  32.2 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  31.36 
 
 
253 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  32.29 
 
 
262 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  31.75 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  33.63 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  31.67 
 
 
259 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  32.86 
 
 
248 aa  88.6  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  30.4 
 
 
280 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  30.49 
 
 
384 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.38 
 
 
258 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  28.71 
 
 
266 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  30.74 
 
 
260 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  32.98 
 
 
260 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  31.08 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  29.86 
 
 
250 aa  85.9  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1157  ABC transporter related  28.64 
 
 
237 aa  85.9  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  29.28 
 
 
269 aa  85.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 
255 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  31.9 
 
 
272 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.81 
 
 
269 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  29.86 
 
 
250 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  31.14 
 
 
266 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.5 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  30.61 
 
 
265 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.99 
 
 
258 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  31.55 
 
 
259 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  29.15 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  32.7 
 
 
250 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  28.92 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  30.62 
 
 
258 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  27.66 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0839  ABC transporter, ATPase subunit  30.22 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.483975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  28.83 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.8 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  31.75 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.67 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  30 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  28.95 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  31.58 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  31.69 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  28.64 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  32.24 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  32.11 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  29.36 
 
 
278 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  33.02 
 
 
282 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 
254 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  30.77 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  31.84 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  30.04 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  27.23 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.57 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  31.06 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  27.9 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  30.57 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1510  ABC transporter related  28.39 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  28.76 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.04 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  29.67 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  32.12 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.65 
 
 
549 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.98 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  31.36 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  29.54 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1517  ABC transporter related  30.62 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000032537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  30.47 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  31.53 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  32.5 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  29.52 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.7 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.65 
 
 
564 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  31.94 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.65 
 
 
549 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  28.57 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  29.2 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  29.58 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  30.16 
 
 
258 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  29.65 
 
 
564 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  29.85 
 
 
260 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  33.02 
 
 
268 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  30 
 
 
275 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 
271 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.54 
 
 
291 aa  79  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  28.83 
 
 
255 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  31.09 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  31.09 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  31.07 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  28.32 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.51 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  31.09 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  31.09 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  27.62 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>