More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1517 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1517  ABC transporter related  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000032537 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1956  ABC transporter related  60.1 
 
 
217 aa  251  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  9.85727e-19 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1091  ABC transporter related  58.99 
 
 
218 aa  248  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00377996  hitchhiker  0.000564642 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2138  ABC transporter related  58.33 
 
 
215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.95 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
229 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  39.49 
 
 
257 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  39.49 
 
 
257 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.03 
 
 
310 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 
361 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  38.46 
 
 
254 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 
361 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  35.92 
 
 
283 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  38.65 
 
 
261 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  32 
 
 
361 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  37.98 
 
 
250 aa  101  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 
352 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  39.29 
 
 
256 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 
368 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
252 aa  99.4  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  38.42 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  30.84 
 
 
361 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  32.76 
 
 
368 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  34.36 
 
 
250 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
255 aa  98.6  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
257 aa  98.2  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  32.45 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
259 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  35.23 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  34.02 
 
 
250 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  36.22 
 
 
296 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 
352 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  36.23 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  34.52 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  40 
 
 
256 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  32.6 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  37.93 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 
361 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  32.18 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  36.75 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  32.18 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 
361 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  31.94 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  34.26 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  33.85 
 
 
255 aa  95.9  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  35.03 
 
 
269 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.29 
 
 
284 aa  95.5  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  37.28 
 
 
264 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
355 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
355 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 
352 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.86 
 
 
418 aa  95.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
253 aa  95.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
490 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.33 
 
 
810 aa  94.7  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0212  ABC transporter related  32.88 
 
 
244 aa  94.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  36.69 
 
 
265 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  37.81 
 
 
296 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  37.81 
 
 
296 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  35.6 
 
 
379 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  37.81 
 
 
296 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 
363 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  38.1 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  34.39 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.84 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 
265 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  30.77 
 
 
250 aa  93.2  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  34.11 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.86 
 
 
628 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.5 
 
 
541 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2076  ABC transporter related  36.55 
 
 
319 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000611241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  35.82 
 
 
271 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.64 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  37.44 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  34.29 
 
 
601 aa  92.8  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1157  ABC transporter related  32.98 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 
361 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  35.82 
 
 
276 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  34.18 
 
 
316 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  33.85 
 
 
262 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 
352 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  37.58 
 
 
256 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 
361 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.82 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  33.96 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  33.33 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.25 
 
 
277 aa  92  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  34.39 
 
 
266 aa  92  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  32.98 
 
 
222 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  37.44 
 
 
298 aa  92  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  33.84 
 
 
252 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  29.08 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  33.85 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>