More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2750 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  100 
 
 		 265 aa  524  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  62.39 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  52.82 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  52.82 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  52.82 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  63.18 
 
 		 269 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  60.98 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  53.09 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  60.57 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  52.24 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  53.5 
 
 		 252 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  60.74 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  59.76 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  60.18 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  52.67 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  54.77 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  58.54 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  52.26 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  58.57 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  50.38 
 
 		 293 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  49.61 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  47.53 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  48.46 
 
 		 304 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  50.81 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  50.81 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  50.4 
 
 		 268 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  54.42 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  50 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  49.59 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  48.68 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  48.47 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  49.56 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  52.54 
 
 		 316 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  53.19 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  51.26 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  53.1 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  50 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  50.44 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  48.23 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  50.66 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  47.79 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  46.98 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  45.45 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  48.7 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  37.96 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.92 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  40.98 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  35.65 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  39.59 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  39.59 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.07 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.5 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  39.5 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  38.86 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  35.4 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.26 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  36.05 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  31.3 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  42.13 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.6 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  31.43 
 
 		 271 aa  131  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1914  ABC transporter related  35.17 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.57 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  31.06 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  35.11 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  33.2 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  30.45 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.57 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  35.24 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  33.64 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.27 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  29.07 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  35.29 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  32.46 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  34.57 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>