More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0189 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  64.04 
 
 
243 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  64.04 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  60.96 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  60.09 
 
 
249 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  58.33 
 
 
243 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  55.51 
 
 
254 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  49.78 
 
 
252 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  49.57 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  49.57 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  49.57 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  48.48 
 
 
252 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  48.05 
 
 
252 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  48.65 
 
 
293 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
298 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
298 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  48.28 
 
 
251 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  46.38 
 
 
301 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  48.23 
 
 
262 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  45.26 
 
 
258 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 
262 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  45.3 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  45.3 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  46.32 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  47.35 
 
 
269 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  47.19 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  47.19 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  47.19 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  46.9 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  47.19 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  47.19 
 
 
268 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  46.75 
 
 
252 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  46.02 
 
 
261 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 
264 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  45.58 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  45.58 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  46.7 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  45.13 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  44.69 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  40 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  45.02 
 
 
261 aa  211  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  44.25 
 
 
256 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  44.69 
 
 
262 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  47.44 
 
 
260 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  50.23 
 
 
283 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  45.13 
 
 
262 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  45.58 
 
 
265 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  46.64 
 
 
259 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  46.19 
 
 
316 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  47.11 
 
 
257 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  48.02 
 
 
275 aa  191  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  41.48 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  40.76 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  39.92 
 
 
243 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  38.72 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
242 aa  158  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  35.32 
 
 
217 aa  155  8e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.48 
 
 
240 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.48 
 
 
240 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.32 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  36.16 
 
 
271 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  36.96 
 
 
269 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
230 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  33.62 
 
 
247 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  32.68 
 
 
257 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  40.35 
 
 
243 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.17 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  31.49 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  32 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
251 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  34.9 
 
 
254 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.64 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
256 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.55 
 
 
251 aa  135  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
256 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.49 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.01 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  32.94 
 
 
256 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  32.44 
 
 
267 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.27 
 
 
257 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 
257 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  38.01 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
256 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  37.96 
 
 
247 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>