More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1702 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  83.33 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  66.23 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  65.22 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  63.6 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  63.6 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  64.07 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  56.57 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  52.77 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  53.42 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  53.42 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  53.42 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  51.49 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  50 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  49.79 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 298 aa  248  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  48.94 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  51.06 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  49.57 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  50.21 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  49.36 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  49.79 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  48.93 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  48.29 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  48.5 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  50 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  50 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  48.67 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  48.23 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  48.67 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  49.36 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  48.02 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  48.23 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  47.35 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  48.23 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  49.78 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  46.9 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  44.25 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  40.48 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  45.58 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.75 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  46.02 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  50.22 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  46.03 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  48.84 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  47.11 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  39.91 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  39.56 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  38.99 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  34.88 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.23 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.89 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  34.2 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  31.67 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  31.67 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  36.57 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  32.88 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  31.92 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  32.07 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  31.34 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  33.46 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  30.28 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.16 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.24 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.32 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  34.51 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  33.59 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.94 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.18 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>