More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1696 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  80.78 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  77.82 
 
 		 303 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  75.29 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  71.77 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  69.06 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  69.06 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  70.54 
 
 		 283 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  52.07 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  51.24 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  52.7 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  51.24 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  50.83 
 
 		 252 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  49.8 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 251 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 251 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 251 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  48.59 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  49.17 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  49.17 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  49.17 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  48.37 
 
 		 251 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  53.28 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  49.64 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  49.46 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  52.44 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  49.26 
 
 		 262 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  50.43 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  49.56 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  48.85 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  47.41 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  51.75 
 
 		 261 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  50.44 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  50.44 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  50.44 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  46.7 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  47.14 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  49.56 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  50 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  49.78 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  52.63 
 
 		 257 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  46.26 
 
 		 262 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  43.25 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  47.79 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  46.38 
 
 		 256 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  47.81 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  46.35 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  41.39 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  45.15 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  40.09 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  41.07 
 
 		 248 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  31.8 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  38.71 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  38.71 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 		 242 aa  146  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.91 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  33.18 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  35.06 
 
 		 266 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  37.07 
 
 		 250 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.13 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  37.06 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  33.65 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  35.37 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  32.74 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 		 255 aa  126  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  36.71 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.81 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  33.96 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  35.59 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  37.61 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  37.38 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.73 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  33.33 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  29.08 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  36.8 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  31.54 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  35.15 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  38.54 
 
 		 257 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>