More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3490 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  47.7 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0334  ABC transporter related  45.99 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000541538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  33.47 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  35.93 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  35.5 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  35.93 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  35.93 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  35.93 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  33.77 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.77 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  32.77 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  34.78 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  34.2 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  34.78 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  32.91 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  35.93 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  36.36 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  33.05 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  35.65 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  35.5 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  33.33 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  33.77 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  32.76 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  35.65 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  34.91 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  35.65 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.96 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  35.65 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  36.75 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  35.65 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  33.93 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  32.13 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 		 298 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  35.22 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.52 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  33.94 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  36.36 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  31.47 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  31.74 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.2 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  30.2 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  34.05 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  34.48 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  31.43 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  31.9 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  32.31 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  37.17 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  34.63 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  33.47 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  36.65 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  33.19 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  37.04 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  33.05 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  35.47 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  34.6 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  34.35 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  29.88 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  30.12 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  33.33 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  33.48 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  31.51 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  32.5 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  29.92 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  31.17 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  34.27 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  31.62 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  32.33 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  32.19 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  31.78 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  29.49 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  31.38 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>