More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  99.2 
 
 		 251 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  77.11 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  77.51 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  77.91 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  75.71 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  76.83 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  74.39 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  76.23 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  61.02 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  54 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  46.35 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  43.7 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  41.35 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  39.92 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  33.9 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.82 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  30.2 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.36 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.14 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  39.62 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.03 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  41.12 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  38.03 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35.59 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  43.13 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  43.13 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  34.41 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  38.74 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  40.99 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0334  ABC transporter related  36.93 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000541538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  38.03 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.73 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  38.03 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  31.91 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  43.19 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  40.48 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.63 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  38.28 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  40 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  40.36 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  35.89 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  35.5 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  41.41 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  39.46 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.88 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.44 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  38.64 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  38.64 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  38.64 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  38.7 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.4 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  38.18 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.07 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  36.67 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  37.39 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  37.6 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  34.01 
 
 		 267 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  39.27 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  34.58 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  33.19 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  32.79 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  35.29 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  33.06 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  40.36 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  41.51 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  29.8 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.28 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  35.29 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  39.46 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.23 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  37.18 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  40.57 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  36.44 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  38.53 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  39.73 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  35.19 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>