More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3928 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  83.67 
 
 		 250 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  83.27 
 
 		 254 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  80 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  80 
 
 		 248 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  79.59 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  76.11 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  75.71 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  61.9 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  51.41 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  42.74 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  41.7 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  40.53 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  40 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  33.47 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.63 
 
 		 308 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  35.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  32.91 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  41.67 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  40.52 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  41.67 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  31.7 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  41.67 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32.91 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  37.17 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.57 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  34.73 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.32 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  36.44 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  38.5 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.49 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.63 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  35.61 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  32.66 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  29.87 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  33.6 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  32.92 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  36.21 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.39 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  35.78 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  30.08 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  31.84 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.99 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.5 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.61 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  34.19 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  37.27 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  34.02 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  37.27 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  33.47 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  37.27 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  34.19 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  32.67 
 
 		 267 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  34.68 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0334  ABC transporter related  38.31 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000541538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  34.93 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  32.61 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.47 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  34.47 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.47 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  36.28 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  30.18 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  34.75 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  31.78 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  38.84 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  35.47 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  35.29 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  36.44 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  35.29 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  35.22 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.61 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  29.24 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  29.33 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  29.33 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  34.93 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  34.06 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>