More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2114 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  95.56 
 
 		 248 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  94.35 
 
 		 248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  92.65 
 
 		 248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  80 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  77.91 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  77.51 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  77.64 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  77.96 
 
 		 254 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  62.18 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  51.6 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  42.92 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  42.92 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  40.33 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  41.63 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  32.91 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  43.84 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  43.84 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.87 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.36 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  43.35 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.26 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  32.77 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  38.79 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  40.27 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0334  ABC transporter related  38.43 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000541538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  42.71 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  39.65 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  34.3 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.04 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  37.87 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.46 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  35.19 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  35.19 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  35.19 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  33.74 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  37.56 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.41 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  36.32 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  40.89 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0292  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.93 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  33.58 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  36.28 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  39.24 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.4 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.37 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.36 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.29 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  35.34 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  35.34 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  32.87 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  31.88 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.63 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.12 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.71 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.71 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.12 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.77 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.77 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  33.74 
 
 		 267 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  32.35 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  34.91 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  28.76 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.56 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  35.32 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  32.9 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  35.34 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  35.68 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  33.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.35 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  35.34 
 
 		 273 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  38.4 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  30.21 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  30.36 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.63 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.65 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  33.33 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>