More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0292 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0292  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0671  ABC transporter related  67.93 
 
 		 247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000490679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0656  ABC transporter related  67.93 
 
 		 247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.57 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  40.26 
 
 		 264 aa  191  6e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.57 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  39.13 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  43.04 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.39 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  39.13 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.57 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.83 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  38.7 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  36.52 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  39.57 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  38.16 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.55 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.21 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.26 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.52 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  36.52 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  37.99 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  36.09 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  35.22 
 
 		 273 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  36.44 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  36.73 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  36.36 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.39 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  37.39 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.78 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  34.93 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  35.93 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.28 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  35.34 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  35.19 
 
 		 300 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  35.94 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  34.87 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  34.78 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  37.23 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  35.78 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.09 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  35.62 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  37.23 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  37.61 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.64 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.33 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  33.05 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.1 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.64 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.02 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  36.89 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.64 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  35.44 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.64 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  37.29 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  37.21 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  37.21 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  37.21 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  32.53 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  32.53 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  33.18 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  34.56 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  35.02 
 
 		 300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  34.56 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  33.64 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  36.57 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.56 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  34.44 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  34.35 
 
 		 310 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  37.02 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0298  ABC transporter related  32.51 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0303285  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  33.64 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  34.63 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  34.19 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4740  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  32.19 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  34.47 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  35.98 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  33.49 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>