More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0298 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0298  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0303285  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  48.15 
 
 
246 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  44.26 
 
 
267 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  45.74 
 
 
249 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  51.17 
 
 
262 aa  178  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  42.45 
 
 
243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  44.72 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  46.6 
 
 
296 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
296 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  42.36 
 
 
298 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  43.15 
 
 
251 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.62 
 
 
248 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  42.93 
 
 
250 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.98 
 
 
258 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  38.11 
 
 
264 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
280 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 
243 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  41.56 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  41.53 
 
 
289 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  42.39 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  35.12 
 
 
266 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
265 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  41.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  43.18 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  42.33 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  42.21 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  42.33 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  42.33 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  32.79 
 
 
280 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  43.85 
 
 
296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  38.59 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  43.16 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
255 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  40.17 
 
 
257 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
296 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  40 
 
 
248 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
254 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  43.46 
 
 
275 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.11 
 
 
275 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  39.58 
 
 
299 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  42.33 
 
 
298 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
254 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 
254 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  43.62 
 
 
288 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  46.6 
 
 
297 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.93 
 
 
275 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  37.45 
 
 
252 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  46.6 
 
 
297 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  37.1 
 
 
262 aa  158  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
254 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
265 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 
265 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
252 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  37.04 
 
 
252 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
263 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
490 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
249 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
249 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.16 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.05 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.58 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.84 
 
 
266 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  40.85 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.05 
 
 
273 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.05 
 
 
273 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.24 
 
 
405 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  43.46 
 
 
265 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.13 
 
 
255 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 
249 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.05 
 
 
273 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.4 
 
 
273 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.48 
 
 
263 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  41.92 
 
 
258 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
249 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
249 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.37 
 
 
262 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  29.1 
 
 
266 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  40.18 
 
 
311 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  41.13 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.08 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.46 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  39.51 
 
 
249 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0671  ABC transporter related  32.95 
 
 
247 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000490679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0656  ABC transporter related  32.95 
 
 
247 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.49 
 
 
251 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.92 
 
 
266 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  34.98 
 
 
280 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  37.74 
 
 
248 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  41.55 
 
 
268 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
247 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.71 
 
 
246 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  39.02 
 
 
252 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
258 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  40.83 
 
 
265 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
536 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.98 
 
 
247 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>