More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0124 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  72.31 
 
 		 244 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  69.29 
 
 		 242 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.35 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  43.93 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  45.11 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  44.68 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  42.74 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.35 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  43.35 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  43.53 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  33.77 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.18 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  36.44 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  34.22 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  32.62 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  31.28 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  34.48 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  35.65 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  32.48 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.32 
 
 		 250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  33.77 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  34.75 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  34.02 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  34.85 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  33.93 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  32.91 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  28.03 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  35.9 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  30.34 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  32.49 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.83 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  33.77 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  31.65 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  32.92 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.83 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  34.5 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  36.36 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  36.36 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  33.91 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  32.34 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  35 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  35.19 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  33.76 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  31.47 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  32.48 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  31.17 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  30.34 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  31.9 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  30.17 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  35.92 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  30.89 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  30.9 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  27.08 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  34.21 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  35.83 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  32.91 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  33.19 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.06 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  34.84 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  29.11 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  31.91 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  35.51 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.02 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.3 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  28.1 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  34.21 
 
 		 299 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  35.51 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  34.91 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  36.53 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  32.5 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>