More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3594 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  54 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  54 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  51.41 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  52.21 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  54.47 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  51.6 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  51.2 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  52.1 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.8 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  44.96 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  43.93 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  42.86 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  35.9 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  37.55 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  30.74 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  37.61 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  33.88 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  39.09 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  33.47 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  30.12 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  31.62 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  38.64 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  31.2 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  35.78 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  35.78 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  35.78 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  38.64 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  38.05 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.81 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  38.05 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  36.8 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  36.05 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  36.02 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  39.07 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  34.2 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  37.9 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.21 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  34.2 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  36.21 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.2 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  37.66 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  35.5 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  36.05 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4740  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  33.62 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  35.27 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  31.97 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.34 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  37.17 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  28.69 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.84 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  29.39 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  33.73 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  34.58 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  33.8 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  32.92 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  38.17 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  34.48 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  35.5 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  34.06 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  33.94 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  35.17 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  35.78 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  35.92 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  30.74 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  36.04 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.75 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.39 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  29.58 
 
 		 286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  32.57 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  34.19 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  32.51 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  30.13 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.03 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.03 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>