More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2143 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  89.29 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  87.3 
 
 		 252 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  86.9 
 
 		 252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  80.56 
 
 		 252 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  78.97 
 
 		 253 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  78.97 
 
 		 253 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  78.97 
 
 		 253 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  76.49 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  76.49 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  75.3 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  75.3 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  75.7 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  75.7 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  75.7 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  76.49 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  75.7 
 
 		 268 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  76.49 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  76.1 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  76.1 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  76.1 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  76.1 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  76.1 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  58.47 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  56.85 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  61.95 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  61.5 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  61.06 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  60.18 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  56.58 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  60.18 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  56.14 
 
 		 262 aa  271  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  59.73 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  59.73 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  59.29 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  58.85 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  57.96 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  52.7 
 
 		 301 aa  261  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  51.05 
 
 		 304 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  51.05 
 
 		 303 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  51.45 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  56 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  51.04 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 298 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  53.22 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  48.15 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  55.31 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  57.33 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  48.46 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  50.66 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  50.63 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  50.66 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  50.66 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  51.1 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  51.33 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  48.9 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  49.14 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  48.99 
 
 		 283 aa  224  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  48.5 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  47.83 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  46.32 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  40.51 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  40.59 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  43.75 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  35.98 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  37.79 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  37.79 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  41.33 
 
 		 308 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  34.63 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.33 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  36.47 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  33.46 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.49 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  35.5 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.96 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1914  ABC transporter related  36.92 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.35 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  35.86 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.27 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  35.29 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.4 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  35.04 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  34.35 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  33.94 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.01 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  33.03 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  32.13 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  35.65 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>