More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0859 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  56.17 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  53.42 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  53.42 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  45.85 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  42.11 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  42.47 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.65 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  37.96 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  38.58 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  36.92 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  40.09 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  40.09 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.95 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.49 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  38.71 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  39.66 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.91 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.91 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  38.02 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  37.96 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  37.5 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.63 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  35.78 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  36.14 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  40.74 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.09 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  35.06 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  36.48 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  36.64 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  39.52 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  34.02 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  34.02 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  34.02 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  34.67 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  35.68 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  41.71 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  37.33 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  37.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  36.41 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  36.41 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  36.41 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  35.68 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  36.41 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  36.41 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  35.94 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  36.24 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.68 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  38.42 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  35.17 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  35.98 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  34.98 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.04 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  36.05 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  35 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  38.53 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.74 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  40.36 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  40.36 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  33.47 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  32.13 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  32.53 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  40.91 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  33.2 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  32.13 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  38.07 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  37.02 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  36.97 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  38.65 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  33.64 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>