More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06744 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  100 
 
 
244 aa  500  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  83.2 
 
 
242 aa  431  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  72.31 
 
 
254 aa  367  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
251 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.7 
 
 
251 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  44.54 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  44.03 
 
 
254 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
250 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  42.92 
 
 
248 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  42.92 
 
 
248 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.49 
 
 
248 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  42.49 
 
 
248 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  41.7 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
230 aa  164  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.74 
 
 
265 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  40.09 
 
 
250 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.27 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.77 
 
 
246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.68 
 
 
268 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  35.06 
 
 
294 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  32.48 
 
 
256 aa  141  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  33.74 
 
 
249 aa  141  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
259 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  34.33 
 
 
250 aa  141  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  35.27 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  34.33 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  34.93 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  33.47 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  34.76 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
255 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  31.36 
 
 
266 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  34.58 
 
 
249 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  32.9 
 
 
266 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  35.02 
 
 
246 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  32.77 
 
 
273 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  37.06 
 
 
262 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
259 aa  135  4e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
260 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  33.48 
 
 
251 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  37.73 
 
 
251 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  33.74 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
237 aa  135  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  31.11 
 
 
252 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  32.17 
 
 
258 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  33.75 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  33.61 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  32.77 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  34.85 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  40.69 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  34.2 
 
 
246 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  31.11 
 
 
252 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  40.69 
 
 
269 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  33.05 
 
 
265 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
263 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30.74 
 
 
236 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  33.77 
 
 
255 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4740  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  39.5 
 
 
252 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  31.03 
 
 
246 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  31.33 
 
 
243 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  31.74 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.86 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  40.35 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  40.35 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  40.35 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  34.18 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  34.02 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  34.82 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  34.22 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  35.87 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  32.86 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  32.47 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  33.61 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  31.47 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  35.47 
 
 
243 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  31.6 
 
 
247 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  33.64 
 
 
250 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  36.55 
 
 
282 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  35.47 
 
 
243 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  39.32 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  30.22 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  34.11 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  29.66 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>