More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1009 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  37.72 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  40.89 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  39.56 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  41.33 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  39.11 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  38.63 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  41.33 
 
 		 243 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  41.33 
 
 		 243 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  38.67 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  36.51 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  38.7 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  38.7 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  38.7 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  39.11 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  40 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  39.64 
 
 		 269 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  40 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  40 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  40 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  38.22 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  39.5 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  38.22 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 230 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  38.22 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  35.78 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  38.22 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  38.39 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  39.11 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  40.89 
 
 		 244 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  37.83 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  39.56 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  33.33 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  39.56 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  38.33 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  37.78 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  38.14 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.14 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  38.22 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  34.78 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0334  ABC transporter related  39.11 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000541538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  38.26 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  37.55 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  37.66 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.36 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  37.9 
 
 		 249 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1914  ABC transporter related  35.59 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  38.63 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  38.62 
 
 		 256 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  36.24 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  32.26 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  36.12 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  36.4 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  34.44 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  34.44 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  32.67 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  39.01 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  35.45 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  35.48 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.41 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  30.88 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  35.19 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.41 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  35.42 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  35.48 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  35.87 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  30.56 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  35.59 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  35.19 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  35.07 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  34.05 
 
 		 251 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  35.75 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  36.97 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 237 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  37.18 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>