More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3181 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  55.6 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  54.39 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  54.11 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  54.11 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  56.58 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  54.11 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  56.58 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  53.88 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  56.14 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  58.88 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  56.12 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  55.7 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 264 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  55.7 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  59.15 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  52.16 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  59.15 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  55.7 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  51.72 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.81 
 
 		 298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  53.88 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  51.05 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  51.72 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  49.39 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  52.61 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  52.17 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  52.17 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  52.17 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  52.17 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  54.42 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  52.17 
 
 		 251 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  51.74 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  51.3 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  53.21 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  50.87 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  51.74 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  55.95 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  49.12 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  51.33 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  51.33 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  48.4 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  51.33 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  50.65 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  45.78 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  48.23 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  52.86 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  47.76 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  46.02 
 
 		 243 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  46.02 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  47.11 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  45.61 
 
 		 243 aa  204  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  44.72 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  42.98 
 
 		 260 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  49.53 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  45.26 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  34.1 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.65 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.65 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  34.45 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.27 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  35.37 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.92 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  33.46 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  36.87 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  36.24 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  31.91 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.97 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1914  ABC transporter related  31.91 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  31.06 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.4 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  37.17 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  37.99 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  36.52 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  37.44 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  31.93 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  34.21 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  33.65 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.92 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.18 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  35.14 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  40.89 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  41.18 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>