More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2717 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  91.48 
 
 		 303 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  78.31 
 
 		 301 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  74.9 
 
 		 316 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  68.89 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  68.89 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  70.98 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  74.7 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  51.88 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  55.02 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  51.46 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 251 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  51.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  50.41 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  51.05 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  51.05 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  50.63 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 253 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 253 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 253 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  50.21 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  51.54 
 
 		 261 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  56.83 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  51.75 
 
 		 257 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  53.07 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  53.33 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  53.33 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  48.44 
 
 		 256 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  48.09 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  50 
 
 		 265 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  48.89 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  50.66 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  49.33 
 
 		 243 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  48 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  50.67 
 
 		 249 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  48.91 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  49.33 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  49.33 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  41.34 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  48.47 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  48.44 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  47.58 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  45.3 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  46.78 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  41.6 
 
 		 260 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  41.44 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  39.29 
 
 		 243 aa  175  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  38.2 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  30.88 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.22 
 
 		 231 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.19 
 
 		 240 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.19 
 
 		 240 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  33.18 
 
 		 240 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  31.92 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  35.86 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  32.52 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  35.14 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  33.65 
 
 		 249 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  36.52 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  31.51 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  34.75 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  33.19 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  33.48 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  35 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 247 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  32.3 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  31.72 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  34.71 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  29.8 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  35.87 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  33.91 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  34.43 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.84 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>