More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7291 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  56.88 
 
 
278 aa  347  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  52.71 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1120  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
290 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.429709 
 
 
-
 
NC_002950  PG1010  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
275 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.784964 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0586  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 
268 aa  161  9e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.559058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  31.88 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  32.86 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  31.4 
 
 
301 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  32.41 
 
 
299 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  29.17 
 
 
299 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
283 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  29.05 
 
 
295 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.82 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.05 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  33.01 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  29.66 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  30.23 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  33.48 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  30.37 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  36.07 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
290 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  29.22 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.51 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  33.01 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  29.72 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.91 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  29.19 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  28.09 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  32.3 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  27.8 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  26.25 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
285 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  28.09 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.09 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  34.17 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  28.09 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  27.4 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  27.4 
 
 
304 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.41 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  27.4 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  30.65 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  33.49 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  33.02 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  29.86 
 
 
233 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  26.43 
 
 
290 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  29.06 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  28.9 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  28.9 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  29.8 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.5 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  28.57 
 
 
319 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  28.22 
 
 
302 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
304 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  30.66 
 
 
244 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  28.84 
 
 
232 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  29.25 
 
 
232 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  32.32 
 
 
298 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  28.7 
 
 
299 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 
291 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  28.64 
 
 
298 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  28.64 
 
 
298 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 
289 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  28.57 
 
 
306 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  27.52 
 
 
274 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  32 
 
 
294 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  28.9 
 
 
283 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  28.9 
 
 
283 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  28.84 
 
 
291 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  30.52 
 
 
306 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>