More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1336 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  67.57 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.06 
 
 		 302 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.02 
 
 		 292 aa  298  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  54.42 
 
 		 285 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  51.41 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  46.57 
 
 		 289 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  44 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  36.9 
 
 		 290 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  39.3 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  40 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.33 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  37.2 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.12 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  38.26 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  43.37 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  36.01 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 238 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  35.59 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  35.15 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  41.4 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  34.98 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.85 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  30.32 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  26.41 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  29.97 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.59 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  32.11 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  32.11 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  27.31 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  30.43 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  29.2 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  27.31 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.44 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.11 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  32.14 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  28.77 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  28.88 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  30.25 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  32.7 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  25.09 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  34.78 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  28.45 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  28.76 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.63 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.44 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  28.32 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  33.95 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  27.4 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  24.65 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  32.88 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  29.26 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  30.56 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  26.06 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 		 236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  31.28 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  30.13 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.13 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.58 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  26.51 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  31.84 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  29.25 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  24.91 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  29.25 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  27.35 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  29.19 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>