More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0186 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  57.09 
 
 		 283 aa  337  9e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  49.3 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  42.31 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  39.45 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  37.54 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.49 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  44.24 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  37.76 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.74 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  39.44 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  35.66 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.52 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  35.76 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  32.12 
 
 		 288 aa  171  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.97 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  30.67 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  32.17 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  36.62 
 
 		 232 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  29.12 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  38.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.82 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  30.47 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  30.88 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  28.72 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  31.91 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  31.94 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  28.35 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  35.21 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.33 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  28.47 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  31.16 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.22 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  33.02 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.55 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.65 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  31.94 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  27.82 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  36.27 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  30.47 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  32.09 
 
 		 232 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 232 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.91 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  33.99 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  33.17 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.18 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.56 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  33.48 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  32.26 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  31.34 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  30.31 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  27.96 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  35.19 
 
 		 228 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  28.9 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  34.48 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1802  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.41 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  26.32 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  31.77 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  29.79 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  33.96 
 
 		 337 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>