More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0445 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0445  ATPase  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  63.73 
 
 
301 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  60.48 
 
 
301 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  54.03 
 
 
297 aa  342  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2218  methyltransferase  44.03 
 
 
280 aa  265  5e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.301934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.82 
 
 
307 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  28.83 
 
 
283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  28.77 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
310 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  33.64 
 
 
280 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  29.22 
 
 
290 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  30.49 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  33.18 
 
 
307 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
307 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
290 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  29.27 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  33.49 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  36.32 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  33.88 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
310 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
301 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  31.41 
 
 
322 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  27.93 
 
 
283 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.44 
 
 
316 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.48 
 
 
305 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  36.41 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  27.4 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
294 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  28.52 
 
 
299 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  34.47 
 
 
307 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.73 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  30.92 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  32.9 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  32.67 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  32.9 
 
 
287 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
242 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  32.9 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  29 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  30.77 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  33.18 
 
 
287 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  32.41 
 
 
310 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  30.52 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  30.72 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  29.03 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  26.55 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  30.39 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  30.39 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  29.03 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  31.49 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  29.97 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  31.68 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  32.39 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.97 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  29.87 
 
 
331 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32.06 
 
 
293 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
287 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  30.23 
 
 
373 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  32.39 
 
 
287 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  34.82 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  28.7 
 
 
280 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  31.63 
 
 
301 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  35.12 
 
 
282 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  28.7 
 
 
280 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.44 
 
 
293 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
295 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
310 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  35.11 
 
 
342 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 
290 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  28.43 
 
 
303 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  30.94 
 
 
240 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  31.92 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  26.8 
 
 
293 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.44 
 
 
309 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 
288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 
288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
300 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
290 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
304 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  25.64 
 
 
284 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.85 
 
 
303 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  30.82 
 
 
344 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  28.93 
 
 
339 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  31.02 
 
 
318 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  31.39 
 
 
324 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  26.74 
 
 
299 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  29.64 
 
 
320 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  30.87 
 
 
298 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>