More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3524 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  47.29 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 283 aa  281  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  47.12 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  44.2 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  42.39 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 		 285 aa  234  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.45 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.94 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1132  ABC transporter related  35.91 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  31.65 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.77 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  30.48 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.33 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  29.1 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  29.95 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  33.63 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  30.52 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  30.4 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  34.26 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  31.56 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.42 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.39 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  27.6 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  31.16 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  28.28 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  31.98 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  31.88 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  31.16 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  28.27 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  31.22 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  32.48 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  27.56 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.78 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  32.21 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  30.08 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  31.63 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.77 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  26.67 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.65 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  27.53 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 340 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  30.08 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  27.68 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  30.08 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  31.53 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  30.28 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  25.09 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  31.19 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  28.76 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  28.67 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.96 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  29.68 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  32.39 
 
 		 232 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  30.14 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  27.75 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  25.96 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.51 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>