More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1205 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  56.74 
 
 
292 aa  323  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  51.42 
 
 
308 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  44.64 
 
 
290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  49.82 
 
 
294 aa  254  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.62 
 
 
322 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  46.57 
 
 
304 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  46.1 
 
 
316 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.36 
 
 
292 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  47.1 
 
 
335 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.8 
 
 
302 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  40.28 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  44.33 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  41.75 
 
 
299 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  41.79 
 
 
308 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  41.75 
 
 
285 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  36.92 
 
 
297 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
301 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  40.22 
 
 
290 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.01 
 
 
290 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  38.52 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  39.44 
 
 
288 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
238 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  36.82 
 
 
288 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  33.67 
 
 
304 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  37.41 
 
 
287 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.79 
 
 
245 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  32.14 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  32.87 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  30.23 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  30.58 
 
 
299 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.05 
 
 
299 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  25.43 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
284 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  32.85 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  27.51 
 
 
297 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  32.84 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  30.12 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
340 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  32 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  27.23 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  26.98 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  30.56 
 
 
232 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  23.94 
 
 
299 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
277 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  30.47 
 
 
291 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 
294 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  30.9 
 
 
309 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.73 
 
 
298 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
369 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  23.96 
 
 
299 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  30.63 
 
 
232 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.55 
 
 
232 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  30.91 
 
 
310 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  30.63 
 
 
232 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  25.68 
 
 
295 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
272 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  29.73 
 
 
243 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  30.63 
 
 
319 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  30.1 
 
 
302 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
338 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  30.13 
 
 
310 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  30.43 
 
 
297 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  28.04 
 
 
229 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  31.63 
 
 
312 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  32.8 
 
 
331 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 
236 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  28.1 
 
 
233 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  28.5 
 
 
285 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  31.55 
 
 
306 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  32.39 
 
 
314 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  30.1 
 
 
302 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  32.74 
 
 
329 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 
285 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  28.43 
 
 
234 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  31.55 
 
 
308 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  26.62 
 
 
301 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  29.96 
 
 
320 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 
232 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  27.16 
 
 
296 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  29.96 
 
 
320 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
261 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  27.66 
 
 
254 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  31.07 
 
 
304 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 
232 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
232 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  31.55 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  29.05 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  32.13 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.55 
 
 
324 aa  99.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  30.58 
 
 
309 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.95 
 
 
293 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  25.5 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  31.46 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.14 
 
 
328 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>