More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1514 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  73.28 
 
 
233 aa  363  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  52.86 
 
 
232 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  43.36 
 
 
232 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  41.23 
 
 
233 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  39.47 
 
 
232 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 
232 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  36 
 
 
293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
230 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  35.37 
 
 
233 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
236 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.35 
 
 
232 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  37.44 
 
 
230 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  33.48 
 
 
232 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
293 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  37.62 
 
 
226 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  35.27 
 
 
293 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 
232 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  32.16 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  37.28 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  35.71 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
232 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
293 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
293 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 
232 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
232 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
293 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
293 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
293 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
293 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
293 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  33.99 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  29.65 
 
 
291 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  32.46 
 
 
243 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  32.74 
 
 
230 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  35.07 
 
 
291 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  35.48 
 
 
264 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  33.95 
 
 
290 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  35.35 
 
 
264 aa  134  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  30.32 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  33.79 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  31.14 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  32.57 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  35.75 
 
 
283 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  29.86 
 
 
293 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  35.32 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
290 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  33.33 
 
 
309 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 
290 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 
290 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
287 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  30.91 
 
 
299 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
290 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.3 
 
 
293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  34.29 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  30.23 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.72 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  32.69 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
290 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  30.53 
 
 
297 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.13 
 
 
337 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  30.26 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.27 
 
 
273 aa  128  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2234  ABC transporter related  33.33 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  31.88 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  30.88 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.91 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
277 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.21 
 
 
288 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  30.1 
 
 
297 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.68 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
295 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  32.2 
 
 
305 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.17 
 
 
299 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  31.73 
 
 
316 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
300 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.31 
 
 
306 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  30.23 
 
 
340 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.36 
 
 
308 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 
311 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  29.22 
 
 
295 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30.59 
 
 
306 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>