More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0187 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.99 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  56.63 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  53.82 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  52.63 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.43 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  39.07 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  38.79 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  41.79 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  45.42 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  42.98 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.59 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  38.08 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  37.5 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  38.89 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.57 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  38.02 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  36.59 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  38.35 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  42.81 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  35.68 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  35.71 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.13 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  29.63 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  31.12 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.19 
 
 		 232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  31.96 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  33.04 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  33.33 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.97 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  28.77 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  35.41 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  27.83 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  32.73 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.4 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  31.28 
 
 		 232 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  31.49 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  32.52 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  32.21 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  32.57 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  29.3 
 
 		 233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  29.18 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  33.91 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  35.19 
 
 		 226 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  29.78 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  29.25 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  31.96 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  33.51 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.56 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.95 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  30.52 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  26.98 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  31.2 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  32.57 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.04 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  28.44 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 		 232 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  30.48 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  30.85 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  34.25 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  30.85 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  28.08 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  27.09 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  30.41 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  29.79 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>