More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2320 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  42.76 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  41.46 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  37.71 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  39.25 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  36.03 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.76 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  32.77 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.51 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  26.94 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  32.87 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  29.86 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.93 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  28.62 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  29.97 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  30.7 
 
 		 233 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  26.74 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  27.3 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  31.53 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  27.62 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.76 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  29.85 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  32.05 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  31.6 
 
 		 232 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  32.17 
 
 		 232 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  26.76 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  32.34 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  25.93 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1523  ABC transporter related  33.94 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.667428  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.33 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  33.48 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  28.4 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  27.49 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.96 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  27.82 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  26.6 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  31.72 
 
 		 245 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  28.05 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0431  ABC transporter related  31.58 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  30.37 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  28.93 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  26.74 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  28.37 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  26.85 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  27.09 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1802  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.22 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  30.9 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.56 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  27.92 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  29.63 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  25.43 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  27.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.77 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  28.15 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  32.88 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.03 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  30.8 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  27.74 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  25.2 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  26.95 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  31.08 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  30.97 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  26.86 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  28.74 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  26.2 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.9 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.92 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.59 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  27.52 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>