More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2267 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  100 
 
 		 295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  44.33 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  46.71 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  47.22 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  35.99 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.58 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  39.58 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  42.39 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.15 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  40.35 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.57 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  35.74 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  35.29 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  32.14 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  34.41 
 
 		 287 aa  178  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.63 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  30.47 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  31.32 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  34.04 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  29.68 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  35.22 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.42 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  28.04 
 
 		 232 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  25 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  33.67 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  34.72 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  30.61 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.33 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  25.4 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  34.3 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  23.53 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  25.7 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  28.84 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  32.74 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  25.78 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2222  ABC transporter related protein  29.95 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  36.2 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.11 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  32.85 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  23.61 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  28.5 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  27.91 
 
 		 233 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  31.63 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  27.14 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.73 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  22.92 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  25.81 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  22.83 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  36.36 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  36.19 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.53 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  29.36 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  30.62 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  28.84 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  23.88 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  26.51 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 236 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.63 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  26.98 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  24.15 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  35.68 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  29.05 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  33.66 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  25.08 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>